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欧盟原材料来自植物或农作物的可再生生物质燃料，包括藻类生物质燃料，已占到欧盟总能源消费结构的7%。过去10年，欧盟及其成员国持续增加藻类生物质燃料技术的研发创新投入，但迄今为止，作为道路交通运输优质的替代燃料，欧盟藻类生物质燃料产业尚未形成真正的商业化经济规模。
欧盟藻类生物质燃料转化技术已基本成熟，转化成本持续大幅度降低，结合有益活性化合物萃取的藻类生物质燃料转化技术，已具备市场竞争力。制约欧盟藻类生物质燃料产业形成经济规模的主要因素，来自藻类种植技术的“优质高产”突破，特别是户外规模化种植技术，需要进一步降低技术生产成本，包括藻类收获采集提纯技术。
欧盟联合研究中心（JRC）组织专家，已对藻类生物质燃料生产消费进行了一次全面的生命周期评估（LCA），分析优势和劣势，积极为欧盟藻类生物质燃料产业可持续发展提供政策建议指导，促进藻类生物质燃料的整体有效性，避免潜在的生态环境风险。
欧盟第七研发框架计划（FP7）和欧盟2020地平线（H2020），已连续5年增加藻类生物质燃料技术的研发创新投入，并在欧盟范围内积极推动藻类生物质燃料产业发展及部署。目前资助支持的研发创新活动，主要聚焦于藻类低成本种植采集技术的联合攻关及中试示范项目。鉴于藻类在开发第二代可再生生物质燃料的巨大潜力，欧盟希望尽早实现技术突破。