加拿大开发出DNA条形码融合技术
查字典生物网
2016-05-09
据最新一期《分子系统生物学》报道，加拿大研究人员开发出一种新技术，可将DNA（脱氧核糖核酸）条形码拼接在单个细胞内，以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。
近年来，DNA条形码技术使科学家开展高并行试验（许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验）成为可能，而新一代DNA测序技术的发展，进一步提高了对条形码计数和读取结果的效率。
然而，可在同一试管内进行的试验次数，却受限于编码的细胞类型数量。一直以来，DNA条形码都是一维的，也就是一个条形码只能做一次试验。允许条形码在细胞内融合在一起，意味着科学家们现在可以打破这一障碍。新技术可显著提高在单一试管内进行的实验次数，在同等成本条件下能将效率提高10倍。
在广泛使用的酵母双杂交（Y2H）方法中，携带一个“诱饵”蛋白的酵母细胞与携带一个“猎物”蛋白的酵母细胞配对。对Y2H系统进行操纵后，只有“诱饵”与“猎物”蛋白黏在一起的细胞才能存活，从而使科学家可以观察到哪些蛋白间互相关联。在被命名为“条形码融合遗传学—酵母双杂交（BFG-Y2H）”的新技术中，携带着数千“诱饵”和“猎物”蛋白的细胞在同一培养皿中配对。
BFG-Y2H方法的新颖之处在于，通过对细胞编程，将来自“诱饵”和“猎物”细胞的DNA条形码连接在一起，形成一个“融合条形码”，然后利用新一代DNA测序方法对融合条形码进行检测。
研究人员称，这项研究的最终目标，是建立蛋白相互作用网络的三维视图，而不是静态图。通过有效建立含有更丰富信息的蛋白相互作用图谱，BFG-Y2H方法可拓展研究人员对细胞工作机理的理解，并展现只在某种特定环境条件下才能发生的蛋白相互作用，从而加速对基因功能和人类疾病的理解。
